海边的度假结束了，分离好像真的要来了。真的到了离别的时候，就算平时莫不相闻，也难免会有所伤心。更何况是朝夕相处了一段时间，小兰心里的不舍在这最后几天被放大到了极限。每天都为柯南准备他平时喜欢吃的东西，毛利小五郎这几天对待柯南的态度也不再像对待一个小鬼，跟像是对待一个亲人。
柯南把一切都看在眼里，他并不是一个小孩子啊。柯南觉得此时的毛利家特别温暖，因为他的父母大多时候都不在家，哪里有过这么温馨的画面。更何况小兰是他青梅竹马的心爱女子，他感觉自己在此时是极度幸福的，对毛利家也有强烈的不舍之情。
可是他现在还是小孩的模样，黑暗组织没有一网打尽，他又怎么告诉小兰真相呢。这一次的分离恰好是一次机会，可以让他放手一搏的机会。
一直寄宿在小兰家，对于调查黑暗组织多有不便，况且小兰去了美国，就不用担心小兰的安慰。他一定要以最大的速度调查出黑暗组织的老巢，以真面目见小兰。
柯南立马就让博士去收集可能和黑暗组织有关的消息，等到他去了博士家立马展开调查。
终于到了小兰要走的那一天，小兰在离开前一夜，一夜没睡。柯南也是一夜没睡，两个人第二天起来都是顶着大大的黑眼圈。一天大家都郁郁寡欢，终于到了离开东京的时候。博士和小哀也来为小兰送行，同时将柯南接走。